註冊會計師的組織單位是註冊會計師協會，中國註冊會計師協會是在財政部黨組和理事會領導下開展行業管理和服務的法定組織。
註冊會計師協會依據《中華人民共和國註冊會計師法》和《社會團體登記條例》的有關規定設立，承擔着《中華人民共和國註冊會計師法》賦予的職能、財政部黨組委託和財政部領導交辦的職能，以及協會章程規定的職能。
在事務所成為執業註冊會計師後，執業證書由省級註冊會計師協會註冊頒發，報中注協備案，隸屬於財政部和中國註冊會計師協會。
註冊會計師協會是由註冊會計師組成的職業團體，其宗旨是服務、監督、管理和協調。中國註冊會計師協會是註冊會計師的全國組織，接受財政部的指導、監督和管理，並接受審計署的監督。
