電子聯行往來指發有電子聯行行號的銀行之間，通過電子計算機網絡進行異地資金劃撥的資金賬務往來活動，一般包括資金清算總中心與分中心的往來、電子發報行與電子收報行的往來以及匯出行與匯入行的往來等。在會計實務中，銀行之間的電子聯行往來可以通過“清算資金往來”科目進行處理，“清算資金往來”科目主要用於核算銀行或金融機構之間業務往來的資金清算款項，該科目可以按資金往來的單位身份設置對應的二級明細科目，如“清算資金往來——同城票據清算”科目、“清算資金往來——信用卡清算”科目等。
