醫院會計的特點在於：1、遵循基金制的會計原則。2、以國家的預算執行情況為基準開展工作。3、以收支結餘核算活動為中心工作。4、視乎實際情況實行權責發生制或收付實現制。5、存在對外投資的核算管理活動。其中醫院會計是以貨幣為計量單位，對醫療服務的經濟過程中運用的經濟資源及其成果進行系統的記錄、計算、分析、檢查，並作出預測、決策、監督的一項旨在提高會計主體效益的經濟管理活動，是醫院經濟管理活動的重要組成部分。
