疫情期間購買藥品會計分錄為：
1、疫情期間企業購買的藥品用於日常支出並取得對應發票的：
借：管理費用（根據費用所屬部門計入相關科目）
應交税費——應交增值税（進項税額）
貸：銀行存款
2、企業購買的藥品用於員工福利的：
借：應付職工薪酬——職工福利費
貸：庫存商品——藥品
應交税費——應交增值税（進項税額轉出）
疫情期間企業購買的藥品，根據實際情況可以通過“管理費用”科目或“應付職工薪酬”等科目處理。對於外購藥品用於員工福利的情況，根據《營業税改徵增值税試點實施辦法》中第二十七條的內容規定，集體福利或者個人消費的購進貨物其進項税額不得從銷項税額中抵扣，因此需要對已抵扣的進項税額進行轉出。
