1、農業企業發生收入時：
借：應收賬款
貸：主營業務收入
應交税費——應交增值税（銷項税額）
2、企業結轉銷項税額時：
借：應交税費——應交增值税（銷項税額）
貸：應交税費——應交增值税（減免税款）
3、結轉減免税費時：
借：應交税費——應交增值税（減免税款）
貸：營業外收入——減免税款
農業企業小規模納税人發生收入後免徵增值税，應通過“應交税費——應交增值税（銷項税額）”科目進行核算，再通過“應交税費——應交增值税（減免税款）”科目進行結轉，最後通過“營業外收入——減免税費”科目進行減免税款的核算。
