1、散熱的模式不同，水冷的要用水塔經過水循環來進行散熱，他沒有金屬散熱器；風冷就是要風扇和散熱器進行熱交換來散熱，用風來帶走熱量。
2、風冷，用風作為散熱介質，其實介質就是空氣，效率相對較低，安裝方便，佔地不大；水冷，就是用水作為散熱介質，效率較高，佔地較大，需要安裝專業的冷卻塔。
3、家用空調，由於受環境，場地限制，一般都會使用風冷，哪怕小型中央空調，這個結構簡單，安裝方便；而商用空調，由於要求製冷功率較大，為了減少能源消耗，提高能源使用效率，基本使用的是水冷。
4、風冷系統不如水冷降温快，水冷系統降温效果明顯。
5、水冷系統比較複雜，佔用體積大。
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