鼠尾草精油功效強大，應該小心使用。因為這種精油含有高濃度的側柏酮成分，當大劑量使用時，會產生抽搐反應，口服這種精油是有害的。在芳香療法中要小心使用，如果鼠尾草精油的毒性困擾着，應該考慮快樂鼠尾草精油，因為它與鼠尾草精油的功效較相似，且沒有負作用。在孕期要避免使用，高血壓和癲癇症患者也要禁止使用。鼠尾草精油不宜長期使用快樂鼠尾草精油；有癲癇症者傾向者勿用快樂鼠尾草精油；快樂鼠尾草精油對部份人可能引起睡意，故且勿將快樂鼠尾草精油於酒類搭配調和，忌勿開車前使用快樂鼠尾草精油。
