馬克筆和水彩筆的區別，主要有以下方面：
1、筆頭。水彩筆的筆頭一般是圓的，而馬克筆的筆頭是扁的，分為纖維型筆頭與發泡型筆頭。
2、墨水。馬克筆有水性、油性和酒精性，而水彩筆只有水性1種。
3、上色。水彩筆不能疊色，馬克筆能疊色，馬克筆比水彩筆更容易上色。
4、用途。水彩筆的優點是水分足，色彩豐富，鮮豔，缺點是水分不均勻，過渡不自然，兩色在一起不好調和，所以一般適合畫兒童畫，也可以用作記號筆。馬克筆的優點是水分均勻，缺點是色彩對比弱一些，但兩在一起可以很好的協調，可以畫建築效果圖，工業設計效果圖。
