原料不同，有機牛奶是指用天然草料餵養的奶牛產出的奶，而普通牛奶是通過人工飼養的方式養出的奶牛擠出的奶；添加劑不同，有機奶在原料採集和加工過程不含任何的添加劑，不含農藥和化學肥料，而普通純牛奶則含添加劑；外包裝不同，有機牛奶的盒子上存在有機認證的標誌，而普通牛奶沒有。。
是按有機標準生產，並經第三方嚴格認證的“最健康，最天然”的奶製品。有機牛奶與普通牛奶的區別主要在於飼養方式、飼料和牛奶的處理過程。有機牛奶的奶牛吃天然牧草長大，牧草施的必須是有機肥料，有機牛奶最大限度地保存了牛奶的天然營養成分。同時在後期加工中，有機牛奶不加入防腐劑、抗生素等物質。
就是普通的牛奶，沒有嚴格要求奶源是有機農場的。相比較來説，有機奶的奶源是有機農場產的，感覺有機牛奶營養價值更高、安全，更有利於健康，乳香更濃、口感更好。除此之外，有機奶的加工過程採用的是物理冷卻的方法，最大限度的保存了原奶粉的鈣、蛋白質及其它的營養成分。
有機牛奶一般要80-90元左右12盒，而普通牛奶只需要40-50元左右12盒，價格差了差不多一倍。之所以價格更貴，是因為有機純牛奶成本更高，而且加工的流程更為複雜。
有機牛奶在其生產和加工過程中絕對禁止使用農藥、化肥、激素等人工合成物質，無機牛奶則允許有限制地使用這些物質。另外，有機牛奶的包裝、貯藏、運輸等過程也都要嚴格遵照有機食品的相關標準。
