玉髓與瑪瑙是同種礦物，但玉髓不是瑪瑙。瑪瑙為有條帶狀紋理的隱晶質石英，玉髓為沒有條帶狀紋理、顏色均一的隱晶質石英。在進行玉石鑑定時，玉髓和瑪瑙的鑑定證書一般均出具為玉髓鑑定證書。
玉髓不是瑪瑙:
瑪瑙
雖然玉髓和瑪瑙屬於同類石英，成分都是二氧化硅，但玉髓不是瑪瑙。首先，玉髓和瑪瑙的外觀不同，玉髓沒有條帶狀紋路，透明度比瑪瑙好，有玻璃和油脂光澤，而瑪瑙的內部條帶狀紋路明顯，呈同心圓環狀。
玉髓
其次，玉髓比瑪瑙的範圍廣。瑪瑙只是玉髓中的一種礦物，主要成不透明或半透明狀，可按內部條紋的形狀，可分為：纏絲瑪瑙、苔紋瑪瑙、縞瑪瑙、條紋瑪瑙和火瑪瑙，玉髓則主要按顏色分類，包含：紅、黃、紫、粉、綠等。
瑪瑙
最後，玉髓和瑪瑙的產比不完全相同。瑪瑙的產地比玉髓廣，除馬達加斯加、巴西，還有中國、美國、澳大利亞、墨西哥和埃及等，玉髓主要作首飾和工藝美術材料之用，瑪瑙常作觀賞物、飾物和玩物居多。
