儘管它們具有相似的外表與穴居習慣，但土撥鼠和地鼠並沒有太多共同之處：它們甚至都不屬於同一科。例如，地鼠屬於囊鼠科，該科還包括更格盧鼠與囊鼠。
與此同時，土撥鼠則是松鼠科成員，並屬於旱獺屬。除了生物學分類之外，這兩種動物之間還存在許多其他明顯的差異。例如，地鼠有無毛的尾巴、凸出的黃色或褐色牙齒、以及用於儲存食物的毛皮頰袋，所有這些特徵都可將它們與土撥鼠區分開。此外，地鼠的腳通常是粉紅色的，而土撥鼠的腳則為褐色或黑色。雖然小地鼠的體重往往約為2磅（約1.8斤）左右，但土撥鼠可以長到13磅（約11.8斤）左右。
儘管這兩種齧齒動物都主要以植物為食，但是地鼠更喜歡根莖和塊莖，而土撥鼠則喜歡植被與水果。這意味着前者很少會從洞穴內外出，而後者則經常去外面溜達。
土撥鼠之所以會在地下挖洞，主要是為了安全與冬眠，它們白天一般會在地面上四處覓食，如果天氣太熱或是變糟，它們才會回到洞裏。不過，這並不一定意味着地鼠更為隱居，因為土撥鼠會在冬季進行冬眠。與此同時，地鼠在冬季則仍然活躍，它們全年都在破壞草坪。
