1、付息方式不同:憑證式國債是一次還本付息的,而電子式國債的付息方式有很多方式,既有按年付息也有利隨本清的;2、申購手續不同:憑證式國債可直接現金購買,電子式國債需要事先開立對應的資金賬户後才能購買;3、發行對象不同:憑證式國債的發行對象是個人或機構,而電子式國債的發行對象僅限個人。