牡丹的品種約有一千多種，比較常見的有紫斑牡丹、矮牡丹、首案紅、玉樓點翠、紫二喬、姚黃、趙粉、脂紅、守重紅、海雲紫、美人紅等。其中矮牡丹是毛茛科、芍藥屬牡丹的變種，它的自然繁殖能力不強，屬於兼性營養繁殖類型，主要依靠根狀莖和根出條繁殖，是中國特有的珍稀野生植物資源，具有重要的藥用和觀賞價值。
紫斑牡丹：紫斑牡丹生長於海拔1100~2800米的山坡林下灌叢中，耐寒、耐旱、適應性強，主產區處於温帶，地跨半乾旱、半濕潤區，喜光，亦耐半蔭，適應於黃土母質上發育的各種土壤。
脂紅：脂紅是牡丹的一種傳統品種，千層台閣型，喜光稍耐半陰，具有一定耐寒性，忌酷熱，適宜高燥，懼濕澇，多用於生態造景、觀賞和藥用。
玉樓點翠：玉樓點翠喜温暖、涼爽、乾燥、陽光充足的環境，喜陽光，也耐半陰，適宜在疏鬆、深厚、肥沃、地勢高燥、排水良好的中性沙壤土中生長。
