1、科屬不同：中山杉是杉科落羽杉屬，水杉是杉科水杉屬；2、花期不同：中山杉在每年的4月下旬開花，水杉在每年的2月下旬開花；3、果期不同：中山杉在每年的10月果熟，水杉在每年的11月果熟；4、胸徑不同：中山杉胸徑可達2米，水杉胸徑可達2.5米。
關於中山杉：
中山杉是杉科落羽杉屬植物，喬木，胸徑可達2米；樹皮為長條片狀脱落，棕色；枝條呈水平開展；樹冠以圓錐形和傘狀卵形為主。樹葉呈條形，互相伴生，葉子較小。雌雄球花為孢子葉球，異花同株；球果圓形或卵圓形，有短梗，向下垂。種子為不規則的三角形或多邊形，皮質較厚。
關於水杉：
水杉：裸子植物杉科。落葉喬木，小枝對生，下垂。葉線形，交互對生，假二列成羽狀複葉狀，長1-1.7釐米，下面兩側有4-8條氣孔線。雌雄同株。球果下垂，近球形，微具4稜，長1.8-2.5釐米，有長柄；種鱗木質，盾形，每種鱗具5-9種子，種子扁平，周圍具窄翅。
