不同省份使用的教材存在差異。全國的大學聯考試卷不是一樣的。
從2002年開始，我國的大學聯考試卷就不再實行全國統一了，而是由基礎教育發展水平相對比較接近的省份共同使用一套題目，例如四川、雲南、廣西、西藏、新疆這些西部地區使用一套試卷，而湖北、湖南、河北、遼寧、福建等省市由於基礎教育發展水平比較接近，使用同一套試卷；而北京、上海、天津由於經濟十分發達，教育也非常出色，所以他們是單獨命題，因此從總體上來看，全國大學聯考試卷是不一樣的。
不同省份使用的教材存在差異受限於歷史原因，原先不同省份之間使用的高中教材，存在一些差異。比如浙江省，2021年參加大學聯考的考生，語文使用的是蘇教版、歷史使用的是人民版，而隔壁的江西省，則是人教版。而上海的語文使用的是華師大版，數學使用的是滬教版。教材不一樣，必然造成內容編排、知識要點存在差異，從出題角度來説，考察重點也會有所差異，所以使用同一張卷考試，既不科學又不公平。
不同省份之間的教育水平存在差異即使是使用全國卷的地區，國家也作了區分。2020年全國卷分了三類，全國卷I使用在安徽、湖北、福建、湖南、山西、河北、江西、廣東、河南等地，全國卷Ⅱ使用在甘肅、青海、黑龍江、吉林、遼寧、寧夏、新疆、內蒙古、陝西、重慶等地，還有全國卷Ⅲ，在雲南、四川、廣西、貴州、西藏等地使用。2021年因為有更多省份參加了大學聯考改革，所以全國卷分了兩類，甲卷在雲南、四川、廣西、貴州、西藏等地使用，乙卷在甘肅、青海、黑龍江、吉林、寧夏、新疆、內蒙古、陝西、安徽、山西、江西、河南等地。
大學聯考是個選拔性考試，如何有效區分出不同層次的學生，讓他們分別去到對應的高校，是必須考慮的。如果要讓全國使用一張卷子，那這個出題就會變得很難，因為不同地區的學生對試題難度的接受程度，是不一樣的。題目難了，很多學生就會做不出；題目簡單了，又難以有效區分出學生水平層次。
不同省份的大學聯考改革進度不一致為了讓大學聯考更好發揮出“指揮棒”作用，探索出一條科學有效的選拔通道，國家推動開展了多輪大學聯考改革。比如江蘇，自2000年實行“3＋X”大學聯考改革以來，光是大學聯考科目的設置，就至少歷經了五輪重大調整，其改革力度和頻率，堪稱“全國第一”。再如浙江，2014年與上海兩地率先試點新大學聯考改革，宣佈不再分文理科，大學聯考科目改為“3+3”模式。
大學聯考改革勢必會影響到考試方式和招生方式，所以開展了大學聯考改革的省份，試卷自然不能和未開展大學聯考改革的省份一樣。
