安徽醫科大學開設的專業有臨牀醫學專業、精神醫學專業、兒科學專業、醫學影像學專業、眼視光醫學專業、預防醫學專業、口腔醫學專業、婦幼保健醫學專業等。
| 序號 | 專業名稱 | 學制 | 類別 |
| 1 | 臨牀醫學 | 五+三 | 理 |
| 2 | 臨牀醫學 | 五 | 理 |
| 4 | 精神醫學 | 五 | 理 |
| 5 | 康復治療學 | 四 | 理 |
| 6 | 兒科學 | 五 | 理 |
| 7 | 麻醉學 | 五 | 理 |
| 8 | 醫學影像學 | 五 | 理 |
| 9 | 眼視光醫學 | 五 | 理 |
| 10 | 醫學檢驗技術 | 四 | 理 |
| 11 | 衞生檢驗與檢疫 | 四 | 理 |
| 12 | 預防醫學 | 五 | 理 |
| 13 | 婦幼保健醫學 | 五 | 理 |
| 14 | 食品質量與安全 | 四 | 理 |
| 15 | 口腔醫學 | 五 | 理 |
| 16 | 公共事業管理 | 四 | 理 |
| 文 | |||
| 17 | 勞動與社會保障 | 四 | 理 |
| 文 | |||
| 18 | 健康服務與管理 | 四 | 理 |
| 文 | |||
| 19 | 信息管理與信息系統 | 四 | 理 |
| 20 | 臨牀藥學 | 五 | 理 |
| 21 | 藥學 | 四 | 理 |
| 22 | 中藥學 | 四 | 理 |
| 23 | 生物科學 | 四 | 理 |
| 24 | 生物技術 | 四 | 理 |
| 25 | 生物醫學工程 | 四 | 理 |
| 26 | 醫學信息工程 | 四 | 理 |
| 27 | 護理學 | 四 | 理 |
| 文 | |||
| 28 | 法學 | 四 | 理 |
| 文 |
