日本一本二本三本的區別在於入取批次、學費上的不同。除此以外，一二三本的辦學範疇略微有差異。一本是公辦範疇，二本多數是公辦範疇，三本一般為民辦範疇。事實上123本都是本科院校，學制為4年，畢業後都能獲得國家承認的學歷。
兩者區別：
錄取批次不同。按照大學聯考成績分為第一批次，對應一本院校。第二批次，對應二本院校。第三批次，對應三本院校。事實上，123本都是本科院校，學制為4年，畢業後都能獲得國家承認的學歷。因此，報考志願的時候，不必過多糾結。
含金量是生源質量、知名度、認可度、師資、軟硬件、學風等各種因素的綜合，也屬於若干年來約定俗成的民間判斷，比如燕山大學是一本，華北理工大學是二本，都是本科，但是即便拋開錄取批次的概念，大家也都知道前者比後者明顯好。
學費不同。一本最便宜，其次是二本、三本。不過具體的情況還要具體分析。有的二本民辦院校就比三本的院校學費要貴。
