1、學習方式不同
統招專升本是指在普通高等學校專科應屆畢業生中選擇優秀學生升入本科進行兩年制的深造學習，修完所需學分，畢業時授予普通高等教育本科學歷證書和學位證書，派發本科就業報到證。
自考專升本是自考性質的本科，即獨立本科段。自考專升本一般稱為專套本，因為其學習形式自由，報考時間和專業不受限制，學習形式主要是業餘時間自學。
2、證書性質不同
統招專升本屬於國家計劃內統一招錄(統招)，列入當年普通高校招生計劃，學習形式為普通全日制，享受與普通四年制本科同等待遇。
自考專升本屬於成人教育大類，自考專升本學歷為非全日制學歷。統招專升本比自考專升本學歷社會認可度要高。
3、入學條件不同
統招專升本招生對象僅限於應屆優秀普通全日制專科畢業生。各省市和學校規定不同。某些省市和學校要求英語三級以上（上海為四級）、無不及格記錄且所報專業必須與所學專業對口，某些省市和學校無此要求，具體情況請參照當年各省的政策。統招專升本只限報考本省本科院校，不允許跨省報考。
自考專升本則可以選擇原專科不同的專業，學校範圍可遍佈全國各地，最後也有學位，可以考研，考公務員，出國留學或找工作所用。
