招生院校、學習方式、入學考試、畢業證含金量都是不同的。大學聯考院校基本上都是全國全日制大學，而自考的主辦院校基本上都是社會培訓機構或是一些大學開展的繼續教育學院。
入學考試
大學聯考實行的是嚴進嚴出制度，考生需要參加全國統一大學聯考考試，只有達到院校規定的錄取分數線才能夠被錄取，而且錄取的考生只有按照學校規定的任務進行完成，才能夠申請畢業，基本上專科學歷學習年限是三年，本科學歷年限是4至5年。
自考實行的是寬進嚴出制度，考生沒有入學考試以及全國統一考試，只要註冊報名成功之後就可以進行學習，專科考生需要考十幾門的科目，本科考生需要考二十幾門的考試科目，考試難度非常的大，所以學習年限是沒有限制的，部分院校像是黑龍江、河南省的部分地區規定是八年，考生考過一門獲得一門科目的合格證書，如果超過學習年限將會取消已經通過的考試成績。
學習方式
再有就是大學聯考考生需要全天都在學校進行面授的學習，只有週末的時候是休息的，而自考考生是通過自主學習，或是社會助學機構進行輔助學習，考生可以選擇面授和網上課件兩種方式進行學習。
畢業文憑
大學聯考畢業文憑上只有報考院校的印章，但是自考的文憑上卻有兩個印章，一個是自考委的，另外一個是報考院校的。雖然自考的文憑在成人教育中含金量是最高的，但是在我國最被社會認可以及含金量最高的還是普通高等教育統招文憑。
