2020年泉州醫學高等專科學校藥品經營與管理專業學費6000/年；藥品生產技術專業學費6600/年。一般情況下，藝術類專業學費比普通專業高一些。泉州醫學高等專科學校依據省（市區）教育廳、物價局文件規定收取學費、住宿費。
依據《福建省物價局福建省財政廳關於我省公辦學校高職專科學費標準有關問題覆函》(閩價費[2012]356號)文件精神,學校一般專業（藥品經營與管理專業、藥品生產技術專業、藥品質量與安全專業）的學費標準為6000元/生/學年，醫學類專業的學費標準為6600元/生/學年，以上學費不包括住宿費及教材費等。
學生退費依據《福建省物價局福建省財政廳福建省教育廳關於規範高等學校和中等職業學校收費管理工作有關問題的通知》（閩價費[2005] 435號）文件執行。
學費依據來源：泉州醫學高等專科學校2020年高職院校分類考試面向普通高中畢業考生招生章程（）
