沒有衝突。強基計劃是依託於大學聯考進行的高校選拔方式，強基計劃以考生的綜合成績錄取，其會考生的大學聯考成績佔綜合成績的比例不低於85%。強基計劃在大學聯考後確定入圍、進行校測，在時間安排上也不影響大學聯考。
1、報名條件。不設立硬性指標，理論上大家有當年大學聯考資格的話都可以報名，成績在一本線以上的可能有機會進校考，所以所有的大學聯考生家長都可以關注。
2、分省錄取。老自主招生是面向全國招生，然後全國統一排名，但是強基計劃是分省招生的，每個省都投放名額，就不存在省份互搶的問題了，這樣有“運氣”的考生就有了撿漏的機會。
3、招生院校。目前36所試點強基計劃的院校就是一流大學A類高校（985高校），雖然老自主招生院校減少了，但是綜合評價的重點院校增加了，或許未來更多的雙一流院校也面向全國進行綜合評價招生了。
4、破格錄取。對於競賽成績突出的考生，留了一條綠色通道。初審條件和錄取條件都予以放寬，甚至比以往的自主招生優惠幅度可能更大。以往自主招生要求要在一本線以上，新的強基計劃的官方指導思想是“原則上要過一本線”，也就是説對於競賽成績特別突出的學生，不排除不夠一本線也被試點高校錄取的可能。這對競賽特別優異的考生是非常有利的。
5、培養模式。實行精英教學，小班教育，配備最好的師資，本科即開始配備導師，逐步探索本碩博連讀模式。這樣的教學條件是真正的大學教育，真正督促學生好好學習，避免了以往大學“嚴進寬出”的情況。
