五朵金花比喻中國古代史分期問題、中國封建土地所有制形式問題、中國封建社會農民戰爭問題、中國資本主義萌芽問題、漢民族形成問題。五朵金花雖然受到政治意識形態的巨大影響並承擔了相應的使命，但我們不能因此而否定它們所具有的學術價值。
古史分期問題：“戰國封建説”、“西周封建説”和“魏晉封建説”等。關注的是“五種生產方式”理論和社會形態學説是否適用於解釋中國歷史，並由此説明中國革命與歷史的前途問題。
資本主義萌芽問題：主要説明即使沒有帝國主義侵略，中國也能發展到資本主義去，即中國歷史會按照馬克思主義的社會形態理論所規定的路線前進，這一理論具有普世性。
農民戰爭問題：主要目的是為歷史上的造反者翻案，論證農民在當前革命中的地位。
封建土地所有制形式和漢民族形成問題也承擔着同樣的意識形態使命。
