二套房申請公積金貸款是可以的，只是相對而言要求更加嚴格。比如説申請貸款時首付為房款總價的40%，貸款利率是公積金貸款利率的1.1倍，二套房面積不能超過144㎡，二套房貸款月供金額不能超過家庭月均收入的35%等。當然了，各地的公積金貸款政策有所不同，還是以所在地官方公佈為準。
以北京市為例，申請公積金貸款時要遵循“認房又認貸”的準則。比如説夫妻雙方在北京有1套住房沒有貸款想要再買一套，那麼是可以申請公積金貸的;再比如説夫妻雙方之前貸款買過一套房已經賣了，現在名下沒有房，也是可以申請公積金貸的。
公積金貸款較商貸利率低很多，因此用户的購房成本會少，為了控制“炒房”現象，對於公積金貸款次數、額度都是有要求和限制的。
購買第二套商品住宅房可以繼續申請使用第二套房公積金貸款，具體條件如下：
1、借款人購買首套房沒有使用公積金貸款或公積金貸款已經還清;
2、借款人家庭現有人均住房面積不得低於當地公積金管理中心規定的面積;
3、借款人需要具有良好的還款能力和個人信用，能夠按時足額的償還貸款;
4、借款人需要支付二套房的首付款不得低於當地相關部門的規定;
5、當地住房公積金管理中心對於二套房公積金貸款的其他條件。
如果第一套房申請的是商業貸款，那麼第二套房申請公積金貸款，就視為第一次申請公積金貸款，條件相對沒有那麼嚴格，如果第一套房也是申請的公積金貸款，那麼第二套房再申請公積金貸款，需要滿足的條件會更多。
