獨立院校的畢業證書國家承認嗎的答案是：認可
獨立學院是由普通本科高校(申請者)與社會力量(合作者,包括企業、事業單位,社會團體或個人和其他有合作能力的機構)合作舉辦的進行本科層次教育的高等教育機構。
是指實施本科以上學歷教育的普通高等學校與國家機構以外的社會組織或者個人合作，利用非國家財政性經費舉辦的實施本科學歷教育的高等學校。獨立學院是民辦高等教育的重要組成部分，屬於公益性事業，依法享有民辦教育促進法、民辦教育促進法實施條例規定的各項獎勵與扶持政策。國務院教育行政部門負責全國獨立學院的統籌規劃、綜合協調和宏觀管理。省、自治區、直轄市人民政府教育行政部門主管本行政區域內的獨立學院工作，依法履行職責。
2008年，教育部發布《獨立學院設置與管理辦法》，要求獨立學院在5年內完成獨立設置。2020年5月18日，教育部辦公廳發佈了《關於加快推進獨立學院轉設工作的實施方案》，2020年12月31日，各獨立學院全部制定轉設工作方案，同時推動一批獨立學院實現轉設。原則上，中央部屬高校、部省合作共建高校舉辦的獨立學院要率先完成轉設，其他獨立學院要儘早完成轉設。截至2021年1月26日，全國獨立學院186所。
一般認為，當時的教育部改革，中國第一所獨立學院產生於1998年，以蘇州大學申辦，蘇州大學教育發展基金會投資的蘇州大學文正學院成為標誌。在創辦初期，這類機構統稱為“二級學院”，後期則稱為“二級學院”或“獨立二級學院”，對申辦高校的“依附性”是它們與生俱來的基本特徵，國家鼓勵轉設，或併入母體。
2003年，以教育部發布《關於規範並加強普通高校以新的機制和模式試辦獨立學院管理的若干意見》為標誌，獨立學院開始在國家政策的支持下向自主辦學機構過渡。
2008年，教育部發布了《獨立學院設置與管理辦法》，提出將於2013年完成獨立學院的改革，並指出了獨立學院繼續作為獨立學院存在、轉設為獨立設置本科學校、撤銷或合併的3條“出路”。
