在1899年3月8日，作為法蘭克福隊前身的維多利亞1899法蘭克福足球隊成立了。同年，法蘭克福1899踢球者隊也宣告成立。兩者於1911年5月合併成為FrankfurterFV(KickersViktoria)，再於1920年加入體操會FrankfurterTurngemeindevon1861而成為TuSEintrachtFrankfurtvon1861。
法蘭克福的成績獲得接納成為於1963年新成立的職業德國甲組聯賽創建的16支球隊之一，此後廿年一直維持在頂級聯賽及在上游位置，獲得5次聯賽季軍，於1992年更僅以2分之微落最終冠軍斯圖加特。
但法蘭克福亦有數次僅僅逃過降級厄運，於季後附加賽兩回合累計分別在1984年以6:1擊敗杜伊斯堡，及1989年以4:1擊敗薩爾布呂肯足球俱樂部。最終法蘭克福在1996至97年賽季聯同凱澤斯勞滕一併降級乙組聯賽，兩支球隊是當時尚能保持德甲席位的四支德甲創建球隊之二。
兩年後法蘭克福獲得乙組冠軍重回甲組，但當季（1998至99年）即需為保級而苦戰到最後一輪比賽，作客5:1擊敗衞冕冠軍凱澤斯勞滕，而主要對手紐倫堡足球俱樂部意外在主場敗陣才獲保留甲組席位。翌季因財務問題而被扣減2分，再次在最後一輪比賽，憑藉比賽末的入球擊敗烏爾姆足球俱樂部而逃出生天。法蘭克福在2004年再次陷入財務困擾而最終降級收場。
