菩提祖師與如來是師兄弟關係。那還是在封神演義中，他們本是一對同門師兄弟，由於政見不合就大打出手，他倆反目成仇，成了極大仇恨的敵人，但如來會點手段，慣用權術，所以，他贏得了戰爭，最後在靈山發展權勢，而菩提祖師則是輸的那一方，輸的人是沒資格談論其他的，所以就只好隱居在斜月三星洞裏。
斜月三星洞裏的菩提祖師教出來了一個孫悟空，這是如來佛祖心知肚明的事情。
所以，如來也就不再過問孫悟空師從何人了。《西遊記》中菩提祖師，佛道合一的名字，道家的氣質打扮，儒家的行事思想，為一個精通道教、佛教及諸子百家的高人形象。亦是重合了當時三教合一的思潮。"靈台方寸"與"斜月三星"都寄託了作者三教合一的思想。
如來，音譯為多陀阿伽陀，佛的十大稱號之一。民間常以我佛如來、如來佛專指佛教創始者釋迦牟尼佛，世尊，即當時的悉達多太子。又稱之為老瞿曇、黃面老子。
實際上如來佛這稱呼是不精確的。如來是佛的德號之一，如來的意思是"無所從來，亦無所去，故名如來"。所以如來與佛，二者只能稱其中一種。
在《西遊記》曾將孫悟空壓在五行山下五百年。《西遊記》和《封神演義》這兩本文學典籍有着很深的淵源，兩者之間的神仙也有一定的共通之處。在西遊記當中，我們都知道如來是西方佛國的領袖，而在封神演義當中，混鯤老祖門下有兩大弟子，一個是準提道人，一個是接引道人，兩人曾經創立了西方教，分別擔任大小教主。
而如來對應的就是其中的接引道人，其後來創立佛教。而菩提祖師，則是自立門户，收徒傳道，不理人間世事。我們都知道，菩提祖師是一個融匯佛道兩家的人物，而西方教的存在就是一個似佛非佛的道教，更別説後來開創了道教的如來。因此我們能夠知道，菩提祖師就是準提道人。
菩提祖師，《西遊記》中的一位祖師級人物，收孫悟空為徒，傳授他七十二般變化、筋斗雲，但菩提祖師卻要求孫悟空出師後不能提起師門狀況。
