分子蒸餾是一種特殊的液--液分離技術，它不同於傳統蒸餾依靠沸點差分離原理，而是靠不同物質分子運動平均自由程的差別實現分離。當液體混合物沿加熱板流動並被加熱，輕、重分子會逸出液麪而進入氣相，由於輕、重分子的自由程不同，因此，不同物質的分子從液麪逸出後移動距離不同，若能恰當地設置一塊冷凝板，則輕分子達到冷凝板被冷凝排出，而重分子達不到冷凝板沿混合液排出。這樣，達到物質分離的目的。
分子蒸餾技術作為一種與國際同步的高新分離技術，具有其它分離技術無法比擬的優點：
1、操作温度低、真空度高、受熱時間短、分離效率高等，特別適宜於高沸點、熱敏性、易氧化物質的分離；
2、可有效地脱除低分子物質、重分子物質及脱除混合物中雜質；
3、其分離過程為物理分離過程，可很好地保護被分離物質不被污染，特別是可保持天然提取物的原來品質；
4 、分離程度高，高於傳統蒸餾及普通的薄膜蒸發器。
