長春工程學院王牌專業有土木工程，電氣工程，工程與環境安全，管理科學與工程，動力工程及工程熱物理，複合光電材料技術與工程等。
| 長春工程學院“十三五”校級重點學科 | |||
| 序號 | 學科名稱 | 學科代碼 | 校重點學科類型 |
| 1 | 土木工程 | 814 | A |
| 2 | 水利工程 | 815 | B |
| 3 | 電氣工程 | 808 | B |
| 4 | 機械工程 | 802 | B |
| 5 | 管理科學與工程 | 1201 | B |
| 6 | 工程與環境安全 | 新興交叉學科 | B |
| 7 | 工商管理 | 1202 | C |
| 8 | 計算機科學與技術 | 812 | C |
| 9 | 地質資源與地質工程 | 818 | C |
| 10 | 動力工程及工程熱物理 | 807 | C |
| 11 | 化學 | 703 | C |
| 12 | 大數據科學與工程 | 新興交叉學科 | C |
| 13 | 環境科學與工程 | 830 | C |
| 14 | 建築學 | 813 | C |
| 15 | 複合光電材料技術與工程 | 新興交叉學科 | D |
| 16 | 設計學 | 1305 | D |
| 17 | 外國語言文學 | 502 | D |
| 18 | 馬克思主義理論 | 305 | D |
| 吉林省“十三五”特色高水平學科 | |||
| 學科代碼 | 優勢特色學科類型 | 學科代碼 | 優勢特色學科類型 |
| 1 | 土木工程 | 814 | A |
| 2 | 電氣工程 | 808 | B |
| 3 | 管理科學與工程 | 1201 | B |
| 4 | 機械工程 | 802 | B |
| 5 | 水利工程 | 815 | B |
| 6 | 工程與環境安全 | 新興交叉學科 | |
