辦理商業貸款後可以辦理公積金貸款買房，購房者如果用商業貸款買的首套房，而且在有每月按時繳納住房公積金，之後也滿足公積金貸款條件的話，是可以再申請公積金貸款買二套房的。
1、款利率有差別
商業貸款五年以上的基準利率是4.9%，公積金貸款五年以上的基準利率是3.25%。
2、貸款比例有差別
一般情況下，同一套房子，商業貸款可以貸7成，而純公積金貸款可以貸到8成。
3、核流程不同
商業貸款是在過户之前審核貸款，而公積金貸款是在辦理過户之後再審核貸款。
4、審批時間不同
商業貸款審批需要20個工作日左右，公積金貸款審批需要40個工作日左右，商業貸款快於公積金貸款。
5、貸款來源不同
商業貸款放款源頭主要是商業銀行等一些房貸機構籌集的社會公眾資金，而公積金貸款則是公積金繳存者繳納的資金。
6、使用人羣不同
商業貸款是給眾人符合貸款條件的人開放的，而公積金貸款只有公積金繳存者才可以享受。
7、息用途不同
商業貸款的利息是商業銀行的盈利，歸相關的投資人，而公積金貸款的利息是政府規定用途，只能用於保障性住房建設。
8、審批機構不同
商業貸款審核只要是銀行決定，決定權在銀行，而公積金貸款的審批是公積金管理中心，決定權在公積金中心，而銀行只是執行機構。
9、年限和額度不同
不同城市不同銀行的規定是不一樣的，但是總的來説商業貸款的貸款年限和額度一般要高於公積金貸款。
10、二套房貸款額度不同
商業貸款對二套房的政策性限制更多，利率更高，而公積金貸款則基本不受二套房貸的政策影響，同樣享受優惠政策。
