工資的差別，在編工資是不在編的2至3倍。學校屬於全額撥款的事業單位，學校沒有經費來源，聘請教師的工資，都是學校通過擠佔辦公經費或其他渠道來解決的。因此工資差別很大，聘請教師多在2000元至2500元之間，崗位都在教學一線，有的還要帶班主任，而正式在編的基本都在4000元以上。
福利的差別，不在編的福利取決於領導。有的學校的領導比較開明，能夠充分體諒代課教師的辛苦，在發放福利時和在編教師一個標準。而有的學校的領導比較精打細算，發放福利時乾脆把代課老師拋開，導致同工不同酬的差距更加明顯。
社會保障的區別，不在編的五險一金基本不買。很多學校只管用人，至於五險一金從不過問。比如住房公積金，因為學校沒有給代課老師建立，買房時不能申請公積金貸款。
職級晉升的區別，不在編的沒有晉升機會。能夠晉升的都是在編的財政供養人員，代課老師工作幹得再好，也沒有機會和渠道得到晉升。每年考核，教育局和人事局的花名冊裏都不包含聘用人員，不在編的教師都是由學校來組織考核。有的幹得非常出色的，學校自主任命，但只在校內承認。
