首先是大小：碗蓮可以用碗和盆養殖在陽台或室內窗台，而睡蓮最小的容器需要缸和水池，只能養殖在室外庭院和花園。
其次是葉片：碗蓮的葉片成圓形，有的葉片浮在水面上，有的在水上面直立。而睡蓮的葉片在一側有一個缺口，其葉片只能浮在水面。
接着是花朵：碗蓮的花辮呈圓形，花朵一般伸到水面上方，在空中開放。而睡蓮開花時其花朵緊貼着水面。
最後是根莖：碗蓮的根是藕，而睡蓮的根是塊莖。
在生物上細分的話，兩者都屬睡蓮科。不過碗蓮是蓮科多年生水生草本花卉。地下莖長而肥厚，有長節，葉盾圓形。花期6至9月，單生於花梗頂端，花瓣多數，嵌生在花托穴內，有紅、粉紅、白、紫黃、綠等色，或有彩紋、鑲邊。堅果橢圓形，種子卵形。
睡蓮是多年生水生草本，根狀莖肥厚。葉柄圓柱形，細長。葉橢圓形，浮生於水面，全緣，葉基心形，葉表面濃綠，背面暗紫。花單生，浮於或挺出水面;花萼四枚，綠色;花瓣通常八片。果實倒卵形，長約3釐米。花大形、美麗，浮在或高出水面，白天開花夜間閉合。
養護方面睡蓮要比碗蓮顯得皮實，管理容易，也易開花。如果是在室外養殖，最好還是睡蓮。如果在室內或陽台養殖，那當然是選擇碗蓮。因為養殖睡蓮需要很大的容器，而碗蓮只需用不漏水的盆即可養殖。
