蚊子的幼蟲稱為孑孓。孑孓用吸管呼吸。攝食有機物及微生物，口的刷毛會產生水流，流向嘴巴。這個時期約維持10～14天，經4次蜕皮後變成蛹。
初孵出的幼蟲長約1.5mm，幼蟲共分四齡。經3次蜕皮，成為第四齡幼蟲時，體長可較第一齡幼蟲增長8倍。幼蟲體分為頭、胸、腹3部，各部着生毛或毛叢。頭部有觸角、複眼、單眼各1對，口器為咀嚼式，兩側有細長密集的口刷，藉助口刷的迅速擺動以攝取水中的食物。
胸部略呈方形、不分節。腹部細長，可見9節。前7節形狀相似，第8節背面有氣孔器與氣門或細長的呼吸管，是幼蟲期分類的重要依據。庫蚊呼吸管細長，伊蚊呼吸管粗短;按蚊缺呼吸管，但有氣門，各腹節背面有掌狀毛，有漂浮作用。在氣温30℃和食物充足的條件下，幼蟲期經約5～8天發育，蜕皮4次變為蛹。
