明朝太祖朱元璋、建文皇帝以及明成祖朱棣都是在南京稱帝的，明成祖朱棣統治後期把首都遷到北京，從明成祖朱棣之後，明朝皇帝都在北京稱帝的，一直到崇禎皇帝為止。1644年李自成攻入北京，崇禎帝自縊，明朝滅亡。明朝宗室在南方建立了多個政權，史稱南明。清兵入關後，陸續擊敗弘光、隆武、紹武等諸政權。1662年永曆帝被殺，南明覆滅。1683年，清軍攻佔台灣，奉明正朔的明鄭覆滅。
