南京浦口有南京信息工程大學、南京工業大學、南京審計大學、南京農業大學、江蘇第二師範學院、南京鐵道職業技術學院、江蘇警官學院、南京大學金陵學院、東南大學成賢學院等9所高校。
南京信息工程大學是一所以大氣科學為特色的全國重點大學，由江蘇省人民政府、中華人民共和國教育部、中國氣象局、國家海洋局共建，是國家首批世界一流學科建設高校、江蘇高水平大學建設高校，中國高校行星科學聯盟成員，入選國家2011計劃、國家特色重點學科項目建設高校。
南京工業大學簡稱南工，是國家國防科技工業局、住房和城鄉建設部與江蘇省共建高校，入選國家2011計劃、111計劃、卓越工程師教育培養計劃，是國家首批深化創新創業教育改革示範高校、全國高校實踐育人創新創業基地、專業學位研究生教育綜合改革試點高校、江蘇省綜合改革試點高校、江蘇省人才強校試點高校、江蘇省落實科技創新改革30條試點高校、江蘇省高水平大學建設重點支持高校、江蘇省重點建設高校。
