疫情消毒水會計科目應當根據費用所屬部門計入相關科目以及二級明細科目“勞動保護費”，具體會計分錄如下：借：管理費用等——勞動保護費（根據勞動保護費用所屬部門計入相應的科目）應交税費——應交增值税（進項税額）貸：銀行存款按照有關規定，購買消毒用品等防護用品的支出，屬於勞動保護支出。根據《企業所得税法實施條例》的規定，疫情期間購進的消毒用品取得合法的税前扣税憑證的情況下，允許税前扣除。
