1、開發商不願接受公積金貸款。現在許多的房地產開發商都不願意接受這種貸款方式，由於公積金貸款買房，對開發商來説，回籠資金較慢。
2、批貸方面較商業貸款額度要少。住房公積金作為職工住房福利政策，並非職工想貸多少就可以貸多少，而是有最高額度限制的。不過，如果個人貸款額度不足時，夫妻可共同申請公積金貸款，這樣貸款額度會高點。
3、對公積金繳存有要求。除了最高額度限制外，如果想要申請公積金貸款，還要滿足一定的繳存時間，比如借款人連續繳存公積金6個月以上等，不過，也有一些城市要求連續繳存12個月以上才能貸款。
4、賬户餘額對貸款額度有影響。公積金賬户餘額會影響貸款額度，如果賬户餘額太少，那麼能申請到的貸款額度就會越低，所以在申請公積金貸款前，最好不要動公積金賬户餘額。
1、初審：由住房資金管理中心對申請人提交的材料進行初步審查，包括申請人資格、貸款額度、貸款期限，初審合格以後，由中心出具《抵押物審核評估通知單》。
2、評估：申請人持《抵押物審核評估通知單》到中心指定的評估機構，對所購買的房屋價值進行評估。經濟適用房不需要評估。
3、審核：申請人持評估機構出具的《評估報告》以及中心要求的初審材料到中心進行貸款審核。如果合格，中心開具《住房資金管理中心擔保委託貸款調查通知單》。
4、辦理擔保手續：申請人持《住房資金管理中心擔保委託貸款調查通知單》，按照自己選擇的擔保方式辦理擔保手續。如果選擇抵押+保證的方式，保證人應該出具書面的擔保函；如果選擇抵押+保險或第三人保證的方式，應該到保險公司投保或到擔保機構辦理委託擔保手續。
5、簽訂借款合同。
6、住房資金管理中心與受託行簽訂委託貸款協議。
7、借款人直接向住房資金管理中心提出貸款申請，受託行業可根據需要，代為收集借款人申請資料，統一交住房資金管理中心審核、審批。
8、住房資金管理中心對每筆貸款金額、期限、利率審批同意後，與受託行簽訂委託貸款合同。
9、受託行按照委託貸款合同約定，與借款人分別簽訂《住房公積金委託貸款抵押合同》、《住房公積金委託貸款質押合同》和《住房公積金委託貸款保證合同》後，辦理借款手續。
10、受託行將貸款直接劃入售房方在受託行開立的指定賬户。
