目前，為了方便運輸，部分木瓜在七八成熟時採收，此時裏面的種子部分還沒有成熟，運到賣的地方再催熟。所以一些成熟的木瓜會有一些白色的籽。 還有一種無籽木瓜品種，木瓜籽先天發育不良，會產生白色種子。這都是正常的，不影響，可以放心吃。
這種木瓜不建議吃，因為這時候的木瓜還沒有完全成熟，吃的話口感不好，不甜。建議多放一段時間催熟了再吃。木瓜種子有兩種顏色，白色和褐色。 青木瓜的種子未成熟時是白色的，成熟的木瓜種子是黑褐色的。大部分人吃木瓜只吃果肉不吃籽，所以一般不吃籽，但木瓜籽可以入藥，加工成化粧品，有一定的藥用價值和護膚價值。
1、木瓜性寒，胃寒體弱者不宜多食，否則易因胃寒而腹瀉或嘔吐。 這是木瓜在食用時要特別注意的地方。 尤其是有寒戰體弱的孕婦不宜食用。
2、小便澀痛者忌食木瓜。
3、對過敏體質者，木瓜對人體有輕微毒性，過敏體質者慎食。
4、孕婦，尤其是青木瓜，吃多了會引起子宮收縮，引起腹痛，不利於胎兒的穩定甚至流產。
