公積金和商貸混合貸款與普通貸款的還款方式是一樣的，借款人每月只要按照還款計劃按時還上當月應還款額即可，銀行一般每個月都會發送賬單給客户的，賬單上會註明當月應還的具體金額是多少。只是組合貸款因為有商貸部分，也有公積金貸款部分，所以一般會設立2個獨立賬户，兩部分分開從2個獨立賬户當中還。
而因為人們在辦理貸款的時候通常都會和銀行簽訂代扣代繳協議，所以客户通常只要保證綁定的銀行卡里餘額充足即可。銀行系統到了還款日那天一般就會自動從客户綁定的銀行卡里扣取相應的金額用作還款，並不需要客户每個月主動去還款。
但若是綁定的銀行卡里餘額不足，或者卡片出現異常狀況，那可能就會導致銀行系統扣款失敗，還不了款，從而造成逾期，影響到個人信用，所以客户要時時留意卡片的狀態。而客户如果想要提前還款，也可以向銀行提出申請。
1、需要注意的是，借款人申請辦理提前還款業務時若貸款處於逾期狀態，則須補齊逾期期間貸款本息及罰息後，貸款業務部門才可受理。住房公積金提前還款應當視自身情況確定，如果您沒有更好的途徑，手頭閒錢較多，那麼可以選擇提前還款，畢竟提前還款可以比原定貸款計劃少還許多利息;還有很重的一點是，同商業貸款提前還款想比，公積金提前還款沒有手續費或違約金，相當於額外節省了一部分開支，所以利用閒置資金進行公積金提前還貸不失為一個省錢的好辦法。
2、有些購房者想每月提前把公積金理得錢取出來，該如何操作呢?組合貸款的公積金部分的錢可以全部從指定的還貸賬户裏面扣，而不從公積金卡里面扣。
如果沒辦理過銀行委託代扣公積金還貸，就能領出公積金，領完後可再辦委託公積金代扣，使用每月的公積金來還貸，這樣可以大限度地、及時地使用您的公積金。一旦委託銀行代扣，公積金賬户就凍結了，直到還完貸款，不得再領取公積金了。
3、公積金還款還可使實行對衝還貸的方式，但前提條件是先衝還公積金貸款，衝還後如尚有餘額可以衝還商業貸款。所以如果您選擇的是月衝，那麼每月在為您衝還公積金貸款的月還款後，您的公積金賬户內尚有餘額的，那麼會繼續為您衝還商業貸款的月還款。
另外，公積金衝還貸扣款順序是：主貸人基本賬户餘額-主貸人補充賬户餘額-參貸人基本賬户餘額-參貸人補充賬户餘額……每次當前一個賬户餘額不足時會自動從下一個賬户中支取;當賬户餘額均不足時，再從您貸款銀行指定的現金還款賬户中扣款。
