兩套房不在一個城市在交易的時候會根據個人名下實有房產情況來確定税費。比如契税，購買首套房面積在90平米以下契税只交1%，90平米以上140以下交2%，面積140平米以上及二套房交3%。
“二套房”是第二套普通自住房的簡稱，是指以借款人家庭(包括借款人、配偶及未成年子女)為單位認定的，借款人家庭人均住房面積高於當地平均水平的，再次向商業銀行申請住房貸款的房貸房。對貸款購買第二套住房的家庭，首付款比例不低於40%，貸款利率不低於基準利率的1.1倍。
1、以借款人家庭(包括借款人、配偶及未成年子女)為單位認定房貸次數;
2、以當地房地產管理部門依據房屋登記信息系統出具的家庭住房總[1]面積為準，借款人家庭人均住房面積已高於當地平均住房水平;
3、已利用住房公積金貸款購房的家庭，再向商業銀行申請住房貸款的房貸房。
對貸款購買第二套住房的家庭，首付款比例不低於40%，貸款利率不低於基準利率的1.1倍。
二套房税費包括：
1、契税
普通住宅，90平方米以下的，首套房的契税為1%，二套房為3%。普通住宅，90平方米—140平方米，首套房契税為為1.5%，二套房為3%。140平方米以上(含140平方米)，首套房的契税為3%，二套房也為3%。
2、個人所得税
購買二套房徵的個人所得税為1%。如果個人轉讓自用5年以上而且是家庭的唯一住宅的免徵個人所得税。但是如果出售自有住房一年內再次買房的就不免徵個人所得税。
3、營業税
如果個人將購買不足2年的住房對外銷售的，全額徵收營業税。如果個人將購買2年以上的住房對外銷售的，免徵營業税。
