食性不同，蜜蜂和馬蜂的食性截然不同，其中蜜蜂是典型的素食性昆蟲，幾乎完全以植物的花粉和花蜜為食，在外界蜜源豐富時蜜蜂還能將花蜜釀製成蜂蜜並存儲在蜂巢中，而馬蜂則是典型的雜食性昆蟲，主要以蛾、蝶等鱗翅目昆蟲及植物的花蜜、果實等為食。巢質不同，蜜蜂和馬蜂的築巢材料不同，其中蜜蜂是用蜂羣中適齡工蜂蠟腺分泌的蜂蠟來修築蜂巢，整個蜂巢由單張或數張垂直於地面且相對平行的巢脾構成，而馬蜂則是用類似紙漿狀的材料築巢，這些紙漿狀材料是工蜂咀嚼乾燥植物並混以分泌物加工而成的。
外觀上不同，蜜蜂和馬蜂的外觀區別明顯，其中蜜蜂體型上偏短和圓，全身被黃褐色或黑褐色絨毛，腰部不明顯，腹部近橢圓形並有環狀色帶，而馬蜂體型上偏細和長，體色多為黑、黃、棕色相間或為單一色，腰部相對較為明顯，腹部光滑或具大小不同的刻點。
性情不同，蜜蜂和馬蜂的性情大有區別，其中蜜蜂的性情相對而言比較温馴，除極少數特殊情況以外一般不輕易發起攻擊，而馬蜂的性情則要暴躁得多且有強烈的護巢本能，有些種類甚至還有一定的領域意識，任何人或動物膽敢過於靠近蜂巢就可能被羣起而攻。毒性不同，蜜蜂和馬蜂的毒性完全不同，其中蜜蜂的毒性相對較弱且毒液呈弱酸性，被蜇後只要用弱鹼性溶液清洗基本不會有什麼問題，而馬蜂的毒性較強且毒液呈弱鹼性，尤其是被大型馬蜂蜇後甚至可能有生命危險，事實上幾乎每年都有馬蜂蜇人致死的報道。
